Activités : Prestations histologiques

Le RHEM propose un large éventail de techniques histologiques adaptées à différents types d’échantillons et besoins expérimentaux :

Les prestations de service dédiées aux échantillons cryopréservés sont réalisés au sein du RHEM-AdV et RHEM-IGMM. Le RHEM-AdV a la particularité de de disposer d’un laboratoire confiné de type 2 pour la coupe d’échantillons humains ou « prion-like ». Pour  plus d’informations, nous vous conseillons de vous rapprocher des ces 2 plateaux via le formulaire de contact.

En plus des prestations de services en cryotomie, les 3 plateaux mettent à disposition des cryostats pour que les utilisateurs puissent couper par eux-mêmes leurs échantillons. L’accès à ces équipements nécessitent une formation préalable. Pour plus d’informations, rapprochez-vous du plateau qui vous intéresse via le formulaire de contact.


L’accès aux techniques histologiques dédiées aux échantillons inclus dans la paraffine est facilité par la mise en place d’un portail électronique de prise de commande (100LIMS4Histo) et d’une navette de collecte et de redistribution des échantillons. Pour avoir accès à ces services, il vous faut prendre contact avec le plateau via notre formulaire de contact en sélectionnant le service RHEM-IRCM.

Le traitement des échantillons en paraffine suit différentes étapes qui vont conditionner la qualité des coupes histologiques. Il est donc recommandé de respecter le protocole de traitement des échantillons dédiés à la paraffine conseillé par le réseau. Pour plus de détails, vous pouvez également lire les documents accessibles sur notre logiciel 100lims4histo.

Les étapes prises en charge par le plateau sont illustrées par ce schéma :

Nous proposons :

  • l’inclusion en paraffine des échantillons selon une orientation spécifique qui définira le plan de coupes.
  • la préparation de lames selon différentes méthodologies de coupe en fonction de la question biologique et le type de tissus (Cf Liste méthodes de coupes).
  • différentes colorations topographiques et histochimiques (Hématoxyline Eosine, Hématoxyline Eosine Safran, PAS, Bleu Alcian, PAS-Bleu alcian, Safranine O-Fast green, Perls, Rouge Sirius, etc).
  • différents marquages immunohistochimiques ou immunofluorescents (marqueurs de prolifération, d’apoptose, de cellules inflammatoires, de vaisseaux sanguins, etc.) avec un automate Ventana Discovery Ultra. Des marquages multiples en visible ou fluorescence peuvent aussi être envisagés (exemple ci-après).

L’ensemble de nos prestations sont disponibles sur un catalogue accessible sur notre logiciel 100lims4histo.

Nous contacter :

Pour avoir la liste exacte contactez le plateau RHEM-IRCM via notre formulaire de contact.

Sur demande, des mises au point de colorations ou d’immunomarquages peuvent être réalisées.

Le « Tissue Micro-Array » (TMA) est une technologie à moyen débit qui permet de rassembler dans un même bloc receveur plusieurs carottes issues de différents blocs donneurs. Ce bloc donneur est ensuite couper pour générer des lames. On peut ainsi analyser l’expression d’une protéine donnée en même temps sur un nombre important d’échantillons (de 90 à 400 carottes en fonction du diamètre des carottes).

Cette technologie a pour intérêt de faire gagner :

  • du temps puisqu’un seul bloc donneur sera coupé et on produira qu’une lame par marquage,
  • des réactifs puisqu’on se limitera au traitement d’une lame/marquage,
  • en reproductibilité puisque tous les échantillons seront traités de manière synchrone et uniforme.

Nous proposons la création à façon de blocs de TMA. Nous disposons pour cela du TMArrayer du MiniCore®3 d’Excilone.

Cet équipement a l’avantage de capture les images des blocs donneurs avant et après carottage. Il donne accès à différents diamètres de carottage : 0.6 mm, 1 mm et 2 mm.  Pour toutes informations complémentaires, contactez le plateau RHEM-IRCM via le formulaire de contact en sélectionnant le service RHEM-IRCM.


Exemple d’une carotte d’oreille murine colorée avec 3 colorations distinctes

Principe

Les lames virtuelles sont des reproductions numérisées du contenu optique d’une lame de verre histologique. Elles sont produites par un scanner. La lecture se fait sur l’écran d’un ordinateur à l’aide d’un système, appelé le viewer, qui reproduit les fonctions d’un microscope. Les applications de cette technologie sont nombreuses : en enseignement, en recherche et en diagnostic.

Sur Montpellier, la plateforme d’imagerie MRI dispose de trois scanners de lames (Hamamatsu, Zeiss et 3DHistech).

Service proposé

En collaboration avec le plateau MRI située à l’INM, nous proposons de numériser sur le scanner Hamamatsu les lames qui ont été produites par le RHEM-IRCM. Pour cela, il suffit d’en faire la demande lors du passage de commande d’histologie sur notre logiciel.

Ce service de numérisation est proposé uniquement pour les lames en fond clair générées par le RHEM. Le RHEM prépare et transmet ces lames à l’équipe du MRI-INM qui les numérise ensuite.

C’est à l’utilisateur de numériser les lames produites indépendamment du plateau paraffine ou les lames d’IF générées par le RHEM. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec l’ingénieur responsable des scanners de lames de MRI sur le site MRI.

Les lames virtuelles obtenues par le plateau paraffine sont rendues accessibles à tous les utilisateurs montpelliérains par le serveur sFTP mis en place par MRI.

Documents utiles

Vous trouverez les documents pour l’utilisation de Filezilla et de NPDview en cliquant ici  (Documents > Général)