Activités
Activités
Développement technologique et ressources histologiques pour la recherche
Activités : Généralités
Le réseau RHEM est ouvert à toute personne ayant des besoins occasionnels ou permanents en histologie expérimentale. Pour connaitre les applications spécifiques à chaque technique histologique cliquez-ci dessous.
Nous sommes en mesure de proposer à tout le personnel scientifique :
🧪 Prestations histologiques
Nous réalisons des traitements histologiques adaptés à tout type d’échantillon : inclus en paraffine, cryopréservés, mais aussi sous forme de tissue microarrays. Le réseau propose également la numérisation de lames pour faciliter l’analyse et le partage des données.
🔬 Expertise anatomopathologique
La cellule anatomo-pathologique, dirigée par Florence Bernex (UM, pathologiste vétérinaire), apporte une expertise spécialisée, depuis la conception du projet jusqu’à l’analyse des lames. Elle couvre l’analyse lésionnelle macro- et microscopique, le choix des colorations ou immunomarquages, et le conseil méthodologique.
⚙️ Mise à disposition de postes techniques
Des postes de travail équipés (microtomes, cryostats, graveurs de cassettes…) sont accessibles sur réservation via un compte MRI. Leur utilisation nécessite une formation préalable assurée par l’équipe RHEM afin de garantir la qualité et la reproductibilité des travaux.
🛠️ Équipements spécialisés
La plateforme dispose d’un parc d’équipements variés couvrant l’ensemble des étapes de la préparation histologique : automates d’imprégnation, stations d’enrobage, microtomes, cryostats, vibratomes, systèmes de numérisation et de microarray tissulaire… Ces outils sont accessibles à la communauté académique comme au secteur privé.
🎓 Formations
Le RHEM organise des formations sur site et des ateliers technologiques en partenariat avec BioCampus Montpellier et le RAM. Ces formations couvrent l’autopsie, les prélèvements, les coupes, colorations et immunomarquages, avec un atelier annuel phare : « De l’autopsie à l’analyse tissulaire ». Elles s’adressent à tous les chercheurs, doctorants, ingénieurs et techniciens impliqués en histologie expérimentale.
Activités : Prestations histologiques
Le RHEM propose un large éventail de techniques histologiques adaptées à différents types d’échantillons et besoins expérimentaux :
Les prestations de service dédiées aux échantillons cryopréservés sont réalisés au sein du RHEM-AdV et RHEM-IGMM. Le RHEM-AdV a la particularité de de disposer d’un laboratoire confiné de type 2 pour la coupe d’échantillons humains ou « prion-like ». Pour plus d’informations, nous vous conseillons de vous rapprocher des ces 2 plateaux via le formulaire de contact.
En plus des prestations de services en cryotomie, les 3 plateaux mettent à disposition des cryostats pour que les utilisateurs puissent couper par eux-mêmes leurs échantillons. L’accès à ces équipements nécessitent une formation préalable. Pour plus d’informations, rapprochez-vous du plateau qui vous intéresse via le formulaire de contact.
L’accès aux techniques histologiques dédiées aux échantillons inclus dans la paraffine est facilité par la mise en place d’un portail électronique de prise de commande (100LIMS4Histo) et d’une navette de collecte et de redistribution des échantillons. Pour avoir accès à ces services, il vous faut prendre contact avec le plateau via notre formulaire de contact en sélectionnant le service RHEM-IRCM.
Le traitement des échantillons en paraffine suit différentes étapes qui vont conditionner la qualité des coupes histologiques. Il est donc recommandé de respecter le protocole de traitement des échantillons dédiés à la paraffine conseillé par le réseau. Pour plus de détails, vous pouvez également lire les documents accessibles sur notre logiciel 100lims4histo.
Les étapes prises en charge par le plateau sont illustrées par ce schéma :
Nous proposons :
- l’inclusion en paraffine des échantillons selon une orientation spécifique qui définira le plan de coupes.
- la préparation de lames selon différentes méthodologies de coupe en fonction de la question biologique et le type de tissus (Cf Liste méthodes de coupes).
- différentes colorations topographiques et histochimiques (Hématoxyline Eosine, Hématoxyline Eosine Safran, PAS, Bleu Alcian, PAS-Bleu alcian, Safranine O-Fast green, Perls, Rouge Sirius, etc).
- différents marquages immunohistochimiques ou immunofluorescents (marqueurs de prolifération, d’apoptose, de cellules inflammatoires, de vaisseaux sanguins, etc.) avec un automate Ventana Discovery Ultra. Des marquages multiples en visible ou fluorescence peuvent aussi être envisagés (exemple ci-après).
L’ensemble de nos prestations sont disponibles sur un catalogue accessible sur notre logiciel 100lims4histo.
Nous contacter :
Pour avoir la liste exacte contactez le plateau RHEM-IRCM via notre formulaire de contact.
Sur demande, des mises au point de colorations ou d’immunomarquages peuvent être réalisées.
Le « Tissue Micro-Array » (TMA) est une technologie à moyen débit qui permet de rassembler dans un même bloc receveur plusieurs carottes issues de différents blocs donneurs. Ce bloc donneur est ensuite couper pour générer des lames. On peut ainsi analyser l’expression d’une protéine donnée en même temps sur un nombre important d’échantillons (de 90 à 400 carottes en fonction du diamètre des carottes).
Cette technologie a pour intérêt de faire gagner :
- du temps puisqu’un seul bloc donneur sera coupé et on produira qu’une lame par marquage,
- des réactifs puisqu’on se limitera au traitement d’une lame/marquage,
- en reproductibilité puisque tous les échantillons seront traités de manière synchrone et uniforme.
Nous proposons la création à façon de blocs de TMA. Nous disposons pour cela du TMArrayer du MiniCore®3 d’Excilone.
Cet équipement a l’avantage de capture les images des blocs donneurs avant et après carottage. Il donne accès à différents diamètres de carottage : 0.6 mm, 1 mm et 2 mm. Pour toutes informations complémentaires, contactez le plateau RHEM-IRCM via le formulaire de contact en sélectionnant le service RHEM-IRCM.
Exemple d’une carotte d’oreille murine colorée avec 3 colorations distinctes
Principe
Les lames virtuelles sont des reproductions numérisées du contenu optique d’une lame de verre histologique. Elles sont produites par un scanner. La lecture se fait sur l’écran d’un ordinateur à l’aide d’un système, appelé le viewer, qui reproduit les fonctions d’un microscope. Les applications de cette technologie sont nombreuses : en enseignement, en recherche et en diagnostic.
Sur Montpellier, la plateforme d’imagerie MRI dispose de trois scanners de lames (Hamamatsu, Zeiss et 3DHistech).
Service proposé
En collaboration avec le plateau MRI située à l’INM, nous proposons de numériser sur le scanner Hamamatsu les lames qui ont été produites par le RHEM-IRCM. Pour cela, il suffit d’en faire la demande lors du passage de commande d’histologie sur notre logiciel.
Ce service de numérisation est proposé uniquement pour les lames en fond clair générées par le RHEM. Le RHEM prépare et transmet ces lames à l’équipe du MRI-INM qui les numérise ensuite.
C’est à l’utilisateur de numériser les lames produites indépendamment du plateau paraffine ou les lames d’IF générées par le RHEM. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec l’ingénieur responsable des scanners de lames de MRI sur le site MRI.
Les lames virtuelles obtenues par le plateau paraffine sont rendues accessibles à tous les utilisateurs montpelliérains par le serveur sFTP mis en place par MRI.
Documents utiles
Vous trouverez les documents pour l’utilisation de Filezilla et de NPDview en cliquant ici (Documents > Général)
Activités : Équipements disponibles
La mise à disposition d’équipement se fait sur tous les plateaux du RHEM. Après inscription et formation par les ingénieurs de RHEM, les utilisateurs et utilisatrices peuvent réserver les équipements en ligne où qu’ils ou elles soient.
Les équipements mis à disposition sont :
- des microtomes Niagara ou classiques,
- des cryostats,
- des graveurs de cassettes,
- des microscopes à champ clair et lumière polarisée.
Pour tout renseignement, prendre contact avec un responsable de plateau.
Activités : Formations
Formations à la demande
Le personnel des plateaux dispense de la formation afin de renforcer les expertises techniques histologiques et histo-pathologiques des chercheurs. Ainsi, des formations à la demande sont proposées sur site : techniques d’autopsie, de prélèvements, de coupes, de colorations et d’immunomarquages…
Pour tout renseignement, veuillez contacter une des responsables de plateaux.
Ateliers technologiques BioCampus
L’Unité de service BioCampus Montpellier met en place des ateliers technologiques de formation destinés à l’ensemble de la communauté scientifique de Biologie-Santé de Montpellier mais également ouverts à l’extérieur et au privé. Dans ce cadre, le RHEM organise chaque année son atelier : « De l’autopsie à l’analyse tissulaire ».
Objectifs et public concerné
Cette formation est destinée à améliorer les connaissances théoriques et pratiques en histologie expérimentale et optimiser la qualité des échantillons reçus par le plateau. Elle s’adresse aux chercheurs, doctorants, post-doctorants, ingénieurs et techniciens directement impliqués dans les projets de recherche. Elle est organisée en partenariat avec le Réseau des Animaleries de Montpellier (RAM).
Activités : Expertise anatomopathologique
Florence Bernex, enseignante-chercheuse à l’UM et pathologiste vétérinaire, dirige la cellule anapath du RHEM et propose son expertise en anatomopathologie animale.
Cette expertise ne se résume pas à une simple analyse morphologique.
Pour tout renseignement complémentaire, veuillez contacter Florence Bernex via notre formulaire de contact .
Activités : Développement technologique
La plateforme RHEM ne travaille pas uniquement sur les projets portés par les chercheurs, elle mène également du développement technologique dans l’intérêt de la communauté scientifique.
